portageでインストールすれば、configでDBの初期化を行うことができる。
> emerge --config =dev-db/mysql-5.1.51
データベースを初期化し、MySQL管理者のパスワードを設定する。portageによる処理の詳細は/usr/portage/eclass/mysql.eclassを参照。手動で初期化スクリプトを実行してもよい。
> /etc/init.d/mysql start > mysql --user=root -p mysql
mysqlそのものの管理データはmysqlというデータベースに保存されている。
mysql> CREATE DATABASE dbname;
データベース「mysql」に接続する。
> mysql --user=root -p mysql
セキュリティのために不要なユーザエントリ（testデータベースへの接続権限）を削除し、testデータベースも削除しておく。
mysql> DELETE FROM db WHERE user=''; mysql> DROP DATABASE test;
データベース「dbname」に関して全ての権限を持つユーザを作成
mysql> GRANT ALL ON dbname.* TO 'user'@'localhost' IDENTIFIED BY 'pass';
上記コマンドはユーザの作成とともに、各ユーザの権限設定を行うことができる。